一、拓撲問題
DNA在結構上主要有三種拓樸構型的變化：超螺旋（supercoiling）、紐結（knotting）與連鎖（catenation）。能夠使DNA在不進行DNA複製與轉錄的時候，盡量維持其緊密性。反之在轉錄或複製過程中，這些拓撲構型將會阻礙反應。
二、分類
拓樸異構酶可依據其作用方式，而分為兩種類型：
1.第一型拓樸異構酶（Type I topoisomerase）：可將一條DNA雙股螺旋完全包覆，並以破壞磷酸雙酯鍵的方式切斷其中一股DNA，使其產生一個小缺口，此時另一股完整的DNA將會穿過此缺口，之後通道重新黏合。屬於這類型的有拓樸異構酶I（topoisomerase I）與拓樸異構酶III（topoisomerase III）等。
2.第二型拓樸異構酶（Type II topoisomerase）：可將一條DNA雙股螺旋上的兩股DNA皆切斷，產生缺口，使另一條雙股螺旋能夠穿過此缺口，之後再將通道重新黏合。屬於這類型的有拓撲異構酶IIα與拓撲異構酶IIβ等。
兩種類型皆可改變DNA的環繞數（linking number）。
＊A. Type I(IA及IB)需要Mg2+當作輔助因子(cofactor)，但不需ATP；Type II則同時需要Mg2+及ATP
資料來源：維基百科
資料來源：史丹佛大學
資料來源：biosiva
三、功能
A. Decatenation：可以把兩個環狀纏繞的DNA解開
B. Relaxation：可以把Supercoil雙股DNA解開成環狀
C. Unknotting：把打結處解開成環狀
▼遺傳物質(genetic material)
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請問 helicase 和 gyrase 這兩個功能 拓樸異構酶都有嗎??
回覆刪除還是這兩個本來就屬於拓樸異構酶底下的
gyrase是E coli. topoisomerase II 的別稱。而 helicase 並不屬於拓樸異構酶，而是一種稱為DnaB酵素的別稱
刪除樓上對helicase的說法我有點疑問，我的想法是
刪除E. coli中有encoded一種基因叫dnaB gene，它具有helicase的功能。 說是dnaB的別稱好像不太正確，這是我的看法~
但helicase的確不是拓僕異構酶。