資料來源:accessexcellence
一、命名
限制酶的命名是根據細菌種類而定,以EcoRI為例:
E | Escherichia | (屬) |
co | coli | (種) |
R | RY13 | (品系) |
I | 首先發現 | 在此類細菌中發現的順序 |
1.第一型限制酶
同時具有修飾(modification)及認知切割(restriction)的作用;另有認知(recognize)DNA上特定鹼基序列的能力,通常其切割位(cleavage site)距離認知位(recognition site)可達數千個鹼基之遠,並不能準確定位切割位點,所以並不常用。例如:EcoB、EcoK。
2.第二型限制酶
只具有認知切割的作用,修飾作用由其他酵素進行。所認知的位置多為短的迴文序列(palindrome sequence);所剪切的鹼基序列通常即為所認知的序列。是遺傳工程上,實用性較高的限制酶種類。例如:EcoRI、HindIII。
3.第三型限制酶
與第一型限制酶類似,同時具有修飾及認知切割的作用。可認知短的不對稱序列,切割位與認知序列約距24-26個鹼基對,並不能準確定位切割位點,所以並不常用。例如:EcoPI、HinfIII。
酵素名稱 | 來源 | 辯識序列 | 切法 |
---|---|---|---|
EcoRI | Escherichia coli | 5'GAATTC
3'CTTAAG
| 5'---G AATTC---3'
3'---CTTAA G---5'
|
BamHI | Bacillus amyloliquefaciens | 5'GGATCC
3'CCTAGG
| 5'---G GATCC---3'
3'---CCTAG G---5'
|
HindIII | Haemophilus influenzae | 5'AAGCTT
3'TTCGAA
| 5'---A AGCTT---3'
3'---TTCGA A---5'
|
TaqI | Thermus aquaticus | 5'TCGA
3'AGCT
| 5'---T CGA---3'
3'---AGC T---5'
|
NotI | Nocardia otitidis | 5'GCGGCCGC
3'CGCCGGCG
| 5'---GC GGCCGC---3'
3'---CGCCGG CG---5'
|
HinfI | Haemophilus influenzae | 5'GANTC
3'CTNAG
| 5'---G ANTC---3'
3'---CTNA G---5'
|
Sau3A | Staphylococcus aureus | 5'GATC
3'CTAG
| 5'--- GATC---3'
3'---CTAG ---3'
|
PovII* | Proteus vulgaris | 5'CAGCTG
3'GTCGAC
| 5'---CAG CTG---3'
3'---GTC GAC---5'
|
SmaI* | Serratia marcescens | 5'CCCGGG
3'GGGCCC
| 5'---CCC GGG---3'
3'---GGG CCC---5'
|
HaeIII* | Haemophilus egytius | 5'GGCC
3'CCGG
| 5'---GG CC---3'
3'---CC GG---5'
|
AluI* | Arthrobacter luteus | 5'AGCT
3'TCGA
| 5'---AG CT---3'
3'---TC GA---5'
|
EcoRV* | Escherichia coli | 5'GATATC
3'CTATAG
| 5'---GAT ATC---3'
3'---CTA TAG---5'
|
KpnI[3] | Klebsiella pneumonia | 5'GGTACC
3'CCATGG
| 5'---GGTAC C---3'
3'---C CATGG---5'
|
PstI[3] | Providencia stuartii | 5'CTGCAG
3'GACGTC
| 5'---CTGCA G---3'
3'---G ACGTC---5'
|
SacI[3] | Streptomyces achromogenes | 5'GAGCTC
3'CTCGAG
| 5'---GAGCT C---3'
3'---C TCGAG---5'
|
SalI[3] | Streptomyces albue | 5'GTCGAC
3'CAGCTG
| 5'---G TCGAC---3'
3'---CAGCT G---5'
|
SphI[3] | Streptomyces phaeochromogenes | 5'GCATGC
3'CGTACG
| 5'---G CATGC---3'
3'---CGTAC G---5'
|
XbaI[3] | Xanthomonas badrii | 5'TCTAGA
3'AGATCT
| 5'---T CTAGA---3'
3'---AGATC T---5'
|
* = 平滑末端(blunt ends)/鈍端切割(blunt end);其餘為黏滯切割(sticky end) |
▼遺傳物質(genetic material)
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