酸鹼催化(Acid-Base Catalysis)


A. HIV蛋白水解酶(HIV Protease)舉例,HIV蛋白水解酶的催化基團是天門冬胺酸,因此歸類於天門冬胺酸水解酶(aspartic protease),圖中箭號代表電子的轉移
a. Asp X的作用像是鹼(帶負電),它從一個活化的水分子中得到一個質子
b. 這個活化的水分子會去攻擊胜肽鍵,形成一個暫時的四面體中間產物
c. Asp Y作用為酸,它會促進四面體中間產物的分解,並釋放出兩個分開的產物,藉由貢獻一個質子給新形成的氨基
d. 隨後穿梭在Asp XAsp Y的質子最後回到水解酶中,變回原本的狀態
e. 結果:肽鍵被水解,Asp X上的電子跑到Asp Y上,因此如要再進行第二次催化反應,必須將Asp Y上的電子轉移回Asp X,變回負電狀態

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