分節基因(segmentation genes)

所控制的蛋白質決定了果蠅幼蟲體節的數量、分界、極性等特性。受精後大約3小時，也就是胚胎中有6000 個細胞時，三種分節基因開始一一表現以控制每個細節基因。分為三類：

1.溝紋基因(Gap Genes)：決定前後軸組織的發育形態，如果發生變異，會導致果蠅幼蟲部分體節的缺失。

2.對規基因(Pair-rule Genes)：把胚胎兩兩分成一單位，控制副節形成，如果此基因變異，相間隔地體小節會消失。